Автор работы: k****************@mail.ru, 28 Ноября 2011 в 12:10, научная работа
Бактеріоциногенність є однією з найбільш поширених систем захисту бактерій. Згідно з Klaenhammer, 99% усіх відомих мікрорганізмів здатні синтезувати, принаймні, хоча б один вид бактеріоцинів. Для деяких видів бактерій можна спостерігати утворення від 10 до 100 різних антибактеріальних пептидів. Сучасний рівень знань про бактеріоцини характеризується значною неоднорідністю – одні кілерні фактори вивчені досконало (коліцини, лактоцини), тоді як про інші відомо лише частково.
стор
Перелік умовних позначень 2
Вступ 3
ОГЛЯД ЛІТЕРАТУРИ
РОЗДІЛ 1 Бактеріоцини
1.1. Класифікація бактеріоцинів……………………………………….. 5
1.2. Бактеріоциногенність та лізогенія………………………………… 6
1.3. Механізми кілерної дії бактеріоцинів на чутливі клітини………. 8
1.4. Генетичні особливості бактеріоцинів родини Pseudomonas…….. 10
1.5. Піоцини……………………………………………………………… 12
ЕКСПЕРЕМЕНТАЛЬНА ЧАСТИНА
РОЗДІЛ 2 МАТЕРІАЛИ ТА МЕТОДИ ДОСЛІДЖЕННЯ
2.1. Використані поживні середовища і культури мікроорганізмів…. 14
2.2. Оцінка особливостей росту P. aeruginosa РАЕ - 22 при різних температурах…………………………………………………..……
14
2.3. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів Pseudomonas aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом використання індуктора різної концентрації.………………………………………………………………...
14
2.4. . Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів Pseudomonas aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом інкубування бактеріальної суспензії при різних температурах.…………………………………………………………………
15
2.5. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів Pseudomonas aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом використання культури продуцента на різних фазах росту.…………………………………………………………………
15
2.6. Визначення кілерної активності отриманих лізатів……………... 16
РЕЗУЛЬТАТИ
3.1. Визначення особливостей росту P. aeruginosa РАЕ – 22 при різних температурах………………………………………………...
18
3.2. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів P. aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом використання індуктора різної концентрації.……………..……..
20
3.3. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів P. aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом інкубування бактеріальної суспензії при різних температурах……
22
3.4. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів P. aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом використання культури продуцента на різних фазах росту……….
23
ВИСНОВКИ………………………………………………………………………… 26
СПИСОК ВИКОРИСТАНОЇ ЛІТЕРАТУРИ
Визначення особливостей росту штама-продуцента проводили з метою оцінки оптимальних умов його інкубування. Було показано, що титр мікроорганізмів в 16, 18, 20, та 22-х годинних культурах був приблизно однаковий, в межах статистичної похибки (табл.. 3.1.).
Таблиця 3.1.
Титр штама-продуцента в добовій культурі.
Тривалість інкубування год. | 16 | 18 | 20 | 22 |
Титр мікроорганізмів КУО/мл | 3,6 х 109 | 2,1 х109 | 1,5 x 109 | 2,65 х109 |
Виходячи із наведеного в подальшій роботі використовували 18-20 годинну культуру, яка характеризується найбільш типовим значенням титру мікроорганізмів.
За культивування при 37°С титр мікроорганізмів після внесення і до 2-х годин спостереження частково знижувався. Після цього спостерігали інтенсивне розмноження із досягненням стаціонарної фази на 5-6 годину інкубування. Час подвоєння штама-продуцента становив 66 хвилин.
Рис. 3.1. Крива росту P. aeruginosa РАЕ - 22 при 37°С
При 28°С вплив температурного фактора був менш вираженим, оскільки в перші дві години інкубування падіння титру не виявилось. В даному випадку було відмічено часткове наростання кількості мікроорганізмів. Досягнення стаціонарної фази росту виявилося на 7-8 годину інкубування. Подовження даного періоду пов’язано із більш інтенсивним вихідним розведенням бактеріальної суспензії, яка в даному випадку становить 1:50. Час подвоєння кількості мікроорганізмів штама-продуцента в даному випадку становив 55 хвилин.
Аналогічно
як і при 28°С, при 20°С зниження титру
мікроорганізмів на перших годинах
інкубування не спостерігалось. Було
характерним поступове
Виходячи із отриманих результатів було зроблено висновок, що для даного штама-продуцента найбільш оптимальною температурою інкубування є 28°С. Саме при зазначеному температурному режиму очевидно слід продовжувати їх інкубування в подальшому.
Рис. 3.2. Крива
росту P. аeruginosa РАЕ
- 22 при 28°С
Рис. 3.3. Крива росту P. aeruginosa РАЕ - 22 при 20°С
3.2. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів P. aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом використання індуктора різної концентрації.
На
первинному етапі оптимізації індукції
визначали концентрацію індуктора
необхідного для отримання
Аналізуючи
отримані результати потрібно відмітити,
що оптимальним використанням
Таблиця 3.2.
Оптимізація
індукції з метою отримання
Індикаторна культура | УКМ P. aeruginosa B – 3 | УКМ P. aeruginosa B – 10 | ||||||
C,мкг/мл A |
0 | 10 | 100 | 500 | 0 | 10 | 100 | 500 |
2 | d 6 мм Л1 К1 | d 5 мм Л1 К1 | d 9 мм Л3 К4 | d 7 мм Л2 К3 | d 7 мм Л3 К3 | d 8 мм Л3 К3 | 9 мм Л4 К3 | d 7 мм Л3 К3 |
4 | d 6 мм Л1 К1 | d 5 мм Л1 К1 | d 9 мм Л3 К4 | d 7 мм Л1 К3 | d 7 мм Л3 К3 | d 7 мм Л3 К3 | d 8 мм Л4 К3 | d 7 мм Л3 К3 |
8 | Л1/2 К1/2 | Л1/2 К1/2 | d 9 мм Л2 К3 | d 7 мм Л1 К3 | d 7 мм Л3 К3 | d 7 мм Л3 К3 | d 8 мм Л4 К3 | d 7 мм Л3 К3 |
16 | — | — | d 9 мм Л1 К1 | d 6 мм Л1 К3 | d 7 мм Л3 К3 | d 7 мм Л3 К3 | d 8 мм Л4 К3 | d 7 мм Л3 К3 |
32 | — | — | d 8 мм Л1 К1 | d 6 мм Л1 К1 | d 7 мм Л3 К3 | d 7 мм Л2 К3 | d 9 мм Л3 К3 | d 7 мм Л3 К3 |
64 | — | — | d 8 мм Л1/2 К1/2 | Л1/2 К1/2 | d 7 мм Л2 К1 | d 7 мм Л1 К1 | d 9 мм Л3 К3 | d 6 мм Л3 К3 |
128 | — | — | d 6 мм Л1/2 К1/2 | — | d 8 мм Л1 К1 | Л1/2 К1/2 | d 9 мм Л2 К3 | d 6 мм Л3 К3 |
256 | — | — | — | — | d 8 мм Л1/2 К1/2 | — | d 8 мм Л1 К3 | d 6 мм Л3 К3 |
512 | — | — | — | — | — | — | d 8 мм Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л1 К3 |
1024 | — | — | — | — | — | — | — | Л1/2 К1/2 |
2048 | — | — | — | — | — | — | — | — |
4096 | — | — | — | — | — | — | — | — |
Примітка. Тут і далі: С мкг/мл – кінцева концентрація налідиксової кислоти в розчині; Л – ефективність лізису; К – характер країв зони лізису; А – кратність розведення вихідного лізату; d – діаметр зони затримки росту; «—» - відсутність активності.
3.3. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів P. aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом інкубування бактеріальної суспензії при різних температурах.
Наступним етапом дослідження було визначення оптимальної температури для індукції бактеріоцинів у максимальних кількостях.
Таблиця 3.3.
Оптимізація
індукції з метою отримання
Індикаторна культура | В-3 | В-10 | ||||
t °С
А од. |
20 | 28 | 37 | 20 | 28 | 37 |
2 | d 6 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 | d 9 мм Л3 К4 | d 9 мм Л3 К4 | — | d 9 мм Л4 К3 |
4 | d 8 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 | d 9 мм Л3 К4 | d 9 мм Л3 К4 | — | d 8 мм Л4 К3 |
8 | d 8 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 | d 9 мм Л2 К3 | d 9 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 | d 8 мм Л4 К3 |
16 | d 8 мм Л3 К4 | d 6 мм Л2 К3 | d 9 мм Л1 К1 | d 9 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 | d 8 мм Л4 К3 |
32 | d 9 мм Л3 К3 | d 8 мм Л2 К3 | d 8 мм Л1 К1 | d 6 мм Л2 К4 | d 8 мм Л3 К4 | d 9 мм Л3 К3 |
64 | d 9 мм Л2 К3 | d 8 мм Л2 К3 | d 8 мм Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л2 К3 | d 8 мм Л3 К4 | d 9 мм Л3 К3 |
128 | d 6 мм Л2 К3 | d 8 мм Л1 К1 | d 6 мм Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л2 К3 | d 8 мм Л3 К4 | d 9 мм Л2 К3 |
256 | d 6 мм Л1 К3 | d 6 мм Л1 К1 | — | d 6 мм Л2 К1 | d 8 мм Л3 К4 | d 8 мм Л1 К3 |
512 | d 6 мм Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л1/2 К1/2 | — | d 6 мм Л1 К1 | d 6 мм Л2 К1 | d 8 мм Л1/2 К1/2 |
1024 | — | — | — | — | d 6 мм Л1/2 К1/2 | — |
2048 | — | — | — | — | — | — |
4096 | — | — | — | — | — | — |
Примітка:
t °С – температура інкубування культури.
Відмічено,
що оптимальною температурою для індукції
виділення бактеріоцинів є 28°С. На індикаторній
культурі УКМ P. Аeruginosa
В-10 максимальна активність становила
1024 Од. На індикаторній культурі УКМ
P. aeruginosa B-3 максимальна активність спостерігалась
при 20 та 28°С і становила 512 одиниць. Лізати
отримані при 37°С проявили досить високу
активність, хоча й нижчу на декілька порядків
від описаних раніше. Дещо нижчою активністю
характеризуються лізати, отримані при
37°С. При цьому на індикаторному штамі
УКМ P. Аeruginosa В-3 дана відмінність є
більш суттєвою.
3.4. Оптимізація індукції з метою отримання бактеріоцинів P. aeruginosa РАЕ – 22 у максимальних концентраціях шляхом використання культури продуцента на різних фазах росту.
Наступним етапом дослідження була перевірка активності лізатів, отриманих шляхом використання культури штама-продуцента на різних стадіях росту. З цією метою добову культуру підрощували протягом 2-5 годин при 28°С і 37°С, після чого вносили індуктор. При цьому титр мікроорганізмів на 2 годину становив 1,6 х 108 КУО/мл при 28°С та 2,3 х 108 КУО/мл при 37°С, на 3 годину 3,75 х 108 КУО/мл при 37°С, на 4 годину 4,95 х108 КУО/мл при 28°С, на 5 годину 6 х 108 КУО/мл при 28°С та 1,95 х 109 КУО/мл при 37°С.
Було показано, що активність лізатів при культивуванні за 37°С (таблиця 3.4.) була нижчою ніж при 28°С (таблиця 3.5.) На індукторній культурі УКМ P. аeruginosa В-3 активність лізатів відрощуваних протягом 3 годин при 37°С становила 128 Од, а на культурі УКМ P. Аeruginosa В-10 1024 Од. при 5 годинах підрощування.
Таблиця 3.4.
Оптимізація індукції бактеріоцинів P. аeruginosa РАЕ – 22 внаслідок внесення культури продуцента на різних фазах росту та інкубування при 37°С.
Індикаторна культура | УКМ P. аeruginosa В-3 | УКМ P. аeruginosa В-10 | ||||
Т, год.
А |
2 | 3 | 5 | 2 | 3 | 5 |
2 | d 6 мм Л2 К3 | d 9 мм Л3 К4 | d 8 мм Л2 К1 | d 6 мм Л3 К3 | d 9 мм Л4 К3 | d 8 мм Л3 К3 |
4 | d 6 мм Л2 К3 | d 9 мм Л3 К4 | d 8 мм Л2 К1 | d 6 мм Л3 К3 | d 8 мм Л4 К3 | d 8 мм Л3 К3 |
8 | d 6 мм Л2 К3 | d 9 мм Л2 К3 | d 10мм Л2 К1 | d 6 мм Л3 К3 | d 8 мм Л4 К3 | d 8 мм Л3 К3 |
16 | d 6 мм Л2 К3 | d 9 мм Л1 К1 | d 8 мм Л2 К3 | d 6 мм Л3 К3 | d 8 мм Л4 К3 | d 8 мм Л3 К3 |
32 | d 5 мм Л2 К3 | d 8 мм Л1 К1 | d 8 мм Л2 К3 | d 6 мм Л3 К3 | d 9 мм Л3 К3 | d 6 мм Л3 К3 |
64 | d 5 мм Л1 К1 | d 8 мм Л1/2 К1/2 | Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л3 К3 | d 9 мм Л3 К3 | d 6 мм Л2 К3 |
128 | — | d 6 мм Л1/2 К1/2 | — | d 6 мм Л3 К3 | d 9 мм Л2 К3 | d 6 мм Л2 К3 |
256 | — | — | — | d 6 мм Л2 К3 | d 8 мм Л1 К3 | d 6 мм Л2 К3 |
512 | — | — | — | d 5 мм Л1 К3 | d 8 мм Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л1 К3 |
1024 | — | — | — | — | — | Л1/2 К1/2 |
2048 | — | — | — | — | — | — |
4096 | — | — | — | — | — | — |
Примітка:
Т – час підрощування культури.
Більш однозначними були результати активності лізатів, отриманих при 28 °С. Так, на обох індикаторних штамах максимальною була активність після підрощування протягом 4 годин. На індикаторній культурі УКМ P. Аeruginosa В-3 активність зазначених речовин становила 1024 Од, а на УКМ P. Аeruginosa В-10 – 4096. Виходячи із наведених результатів було зроблено висновок, що оптимальними умовами для отримання бактеріоцинів є підрощування протягом 4 годин при 28°С. В даний період культура знаходиться в експоненційній фазі росту, що очевидно, має суттєве значення для оптимізації індукції з метою підвищення кілерної активності лізатів.
Таблиця 3.5.
Оптимізація індукції бактеріоцинів P. аeruginosa РАЕ – 22 внаслідок внесення культури продуцента на різних фазах росту та інкубування при 28°С.
Індикаторна культура | В-3 | В-10 | ||||
Т год.
А од. |
2 | 4 | 5 | 2 | 4 | 5 |
2 | d 8 мм Л3 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 6 мм Л2 К3 | d 8 мм Л4 К4 | d 6 мм Л4 К4 | d 8 мм Л4 К4 |
4 | d 8 мм Л3 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 6 мм Л2 К3 | d 8 мм Л4 К4 | d 6 мм Л4 К4 | d 7 мм Л4 К4 |
8 | d 8 мм Л3 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 6 мм Л2 К3 | d 8 мм Л4 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 8 мм Л4 К3 |
16 | d 8 мм Л3 К4 | d 6 мм Л2 К3 | d 6 мм Л1 К1 | d 8 мм Л4 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 7 мм Л4 К3 |
32 | d 8 мм Л2 К3 | d 6 мм Л2 К3 | d 6 мм Л1 К1 | d 6 мм Л4 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 |
64 | d 8 мм Л2 К3 | d 6 мм Л2 К3 | d 6 мм Л1 К1 | d 6 мм Л3 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 |
128 | d 8 мм Л1 К3 | d 6 мм Л2 К3 | Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л3 К4 | d 7 мм Л3 К4 | d 8 мм Л3 К4 |
256 | d 8 мм Л1 К3 | d 6 мм Л1 К1 | — | d 6 мм Л3 К4 | d 6 мм Л3 К4 | d 8 мм Л2 К3 |
512 | Л1/2 К1/2 | d 6 мм Л1 К1 | — | d 6 мм Л2 К3 | d 6 мм Л2 К3 | Л1/2 К1/2 |
1024 | — | Л1/2 К1/2 | — | d 6 мм Л1 К1 | d 6 мм Л1 К3 | Л1/2 К1/2 |
2048 | — | — | — | Л1/2 К1/2 | Л1/2 К1/2 | — |
4096 | — | — | — | — | Л1/2 К1/2 | — |